首先，報(bào)考的條件不一樣。企業(yè)管理碩士只要符合國家統(tǒng)一的報(bào)考規(guī)定即可，也就是說，應(yīng)屆生與在職人員均可報(bào)考。報(bào)考MBA必須是大學(xué)本科畢業(yè)后有3年或3年以上工作經(jīng)驗(yàn)的人員；大專畢業(yè)后有5年或5年以上工作經(jīng)驗(yàn)的人員；已獲碩士學(xué)位或博士學(xué)位并有2年或2年以上工作經(jīng)驗(yàn)的人員（指畢業(yè)日到入學(xué)日）。
　　其次，考試科目不一樣。MBA入學(xué)考試要參加全國試點(diǎn)62所院校的聯(lián)考，聯(lián)考科目是政治、數(shù)學(xué)、英語、管理、語文與邏輯。
　　第三，試題難度不同。一般來說，報(bào)考企業(yè)管理碩士參加的全國統(tǒng)一入學(xué)考試英語、數(shù)學(xué)的難度要高于MBA，但由于近年來國內(nèi)MBA報(bào)考人數(shù)直線上升，競爭也相應(yīng)越來越激烈。
　　第四，培養(yǎng)方式不同。企業(yè)管理碩士生一般為國家培養(yǎng)，每個(gè)月有200元以上的補(bǔ)助，也有委托培養(yǎng)和自籌經(jīng)費(fèi)培養(yǎng)的學(xué)生，MBA一律為自籌經(jīng)費(fèi)或者單位委培。
　　第五，培養(yǎng)目標(biāo)不同。MBA的培養(yǎng)目標(biāo)是優(yōu)秀的企業(yè)家和實(shí)踐工作人員，如清華大學(xué)經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院MBA畢業(yè)生應(yīng)當(dāng)能夠勝任工商企業(yè)和經(jīng)濟(jì)管理部門中、高級(jí)職務(wù)的工作，是能夠適應(yīng)未來社會(huì)激烈競爭的復(fù)合型人才。北大光華管理學(xué)院MBA項(xiàng)目面向跨國公司、大型國有企業(yè)、大型民營企業(yè)和大型金融機(jī)構(gòu)。光華管理學(xué)院致力于幫助跨國公司管理隊(duì)伍本地化，民族企業(yè)管理國際化，民營企業(yè)管理現(xiàn)代化。所以MBA課程注重實(shí)用性。企業(yè)管理碩士既要培養(yǎng)企業(yè)的實(shí)際管理人員，同時(shí)注重對(duì)學(xué)員管理科學(xué)理論的教育，為學(xué)科的發(fā)展培養(yǎng)接班人。一般情況下，企業(yè)管理碩士畢業(yè)生理論功底扎實(shí)，MBA學(xué)員因?yàn)槠淙雽W(xué)前已經(jīng)有相當(dāng)?shù)膶?shí)踐經(jīng)驗(yàn)，同時(shí)學(xué)習(xí)過程中也注重與實(shí)踐的結(jié)合，能很快適應(yīng)企業(yè)的實(shí)際工作。